数据库安全是一个过程，而不是一个方法，它贯穿在我们使用和维护MySQL数据库的过程中。这不单是系统管理员工作，用户也要有安全的意识，使安全问题得到有效控制。MySQL服务器的安全问题可分为内部安全和外部安全两部份。内部安全问题大都与系统文件有关，我们需确保MySQL程序文件和数据文件的安全。外部安全是指通过网络连接到服务器的安全问题，应该只允许合法用户访问数据库，在一些情况下还可用SSL加密信息传输通道。下分别介绍内部安全和外部安全的防范措施。
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在重设置文件权限时，请先关闭数据库服务器。
用以下命令把MySQL安装程序目录的属主和所属组设置为MySQL管理员帐号的用户名和用户组名。
% chown -R mysql.mysql /usr/local/mysql
另外一种方法是把除数据目录外的所有目录属主设置为root所有，如：
% chown -R root.mysql /usr/local/mysql % chown -R mysql.mysql /usr/local/mysql/data
设置安装目录及各有关子目录的权限，允许管理员进行所有操作，只允许其他人进行读和执行访问，设置命令如下：
#设置mysql目录 % chmod 755 /usr/local/mysql or % chmod u=rwx,go=rx /usr/local/mysql #设置mysql/bin目录 % chmod 755 /usr/local/mysql/bin or % chmod u=rwx,go=rx /usr/local/mysql/bin #设置mysql/libexec目录 % chmod 700 /usr/local/mysql/libexec or % chmod u=rwx,go-rwx /usr/local/mysql/libexec
把数据目录及目录中的所有子目录和文件设置为只允许MySQL管理员访问。
% chmod -R go-rwx /usr/local/mysql/data
如果数据目录下有选项文件或套接字文件，并一些客户需访问这些文件，则可用以下的权限设置，使客户在没有读权限的前提下使用这些文件：
% chmod go+x /usr/local/mysql/data
mysql.sock套接字文件一般放以/tmp目录下，要确保该目录设置了粘着位，使自户只能删除自已创建的文件，不能删除其他用户创建的文件。/etc/my.cnf中公共选项文件，是对所有用户可读的，所以不应把一些敏感信息保存在里面。.my.cnf是用户专用选项文件，要确保只有该用户有权访问。
这样设置以后，只有MySQL管理员才能启动服务器。