当Windows Server 2008 R2在2009年或者2010年发布的时候(这是目前预计的时间段)，这个发布版本将有一些重要的功能。
Windows Server 2008 R2(第二发布版)的一个最突出的特点是它只是一个x64平台。这将使升级到x64平台成为很平常的事情，因为目前所有的服务器级硬件都能够进行64位计算。在Windows Server 2008 R2发布之前，32位Windows在2008年还有最后一次发布的机会。因此，对于在x64平台上很难运行的应用程序来说，现在可以采用32位版本。
除了处理器的变化之外，下面是Windows Server 2008第二发布版的其它一些重要功能：
改进Hyper-V技术：Hyper-V计划提供动态迁移功能，作为最初发布版中快速迁移功能的一个改进;Hyper-V将以毫秒计算迁移时间。与VMware公司的ESX或者其它的管理程序相比，这个功能是Hyper-V的一个强项。Hyper-V还将支持额外的处理器和二级解析。
PowerShell 2.0：PowerShell 2.0已经以测试版和用户技术预览版的方式发布了，不过，它将在Windows Server 2008 R2正式发布的时候完全融入到这个软件中。PowerShell 2.0包括240多个新的指令以及一个图形用户界面。而且，PowerShell将能够安装到Windows服务器内核。
Core Parking: Windows Server 2008的这个功能将不断地评估多核服务器的处理工作量，并且能够在某种情况下终止向这些内核发送新工作。然后，在内核闲置的时候，它可以让服务器进入睡眠状态，减少服务器的整个耗电量。
所有这些新功能都将是受欢迎的，并且为Windows服务器管理员增加更大的功能。取消对x86支持并不完全使人意外。但是，现在应该采取一些措施考虑如何解决老式的应用程序的问题。