CentOS或Red Had Enterprise Linux 4 的用户要首先要打开SElinux，方法是修改/etc/selinux/config文件中的SELINUX="" 为enforcing 。它可以保证你的系统不会非正常的崩溃。有些人认为应该关闭，我强烈不推荐，当然只是将centos用来玩玩，不是用于实际服务器则无所谓了。
2、启用iptables 防火墙，对增加系统安全有许多好处。设置好防火墙的规则。
3、执行setup 关闭那些不需要的服务 ,记住少开一个服务，就少一个危险。
4、禁止Control-Alt-Delete 键盘关闭命令
在"/etc/inittab" 文件中注释掉下面这行（使用#）：
ca::ctrlaltdel:/sbin/shutdown -t3 -r now
改为：
#ca::ctrlaltdel:/sbin/shutdown -t3 -r now
为了使这项改动起作用，输入下面这个命令：
# /sbin/init q
5、给"/etc/rc.d/init.d" 下script文件设置权限
给执行或关闭启动时执行的程序的script文件设置权限。
# chmod -R 700 /etc/rc.d/init.d/*
这表示只有root才允许读、写、执行该目录下的script文件。
6、修改"/etc/host.conf"文件
"/etc/host.conf"说明了如何解析地址。编辑"/etc/host.conf"文件（vi /etc/host.conf），加入下面这行：
# Lookup names via DNS first then fall back to /etc/hosts.
order bind,hosts
# We have machines with multiple IP addresses.
multi on
# Check for IP address spoofing.
nospoof on
第一项设置首先通过DNS解析IP地址，然后通过hosts文件解析。第二项设置检测是否"/etc/hosts"文件中的主机是否拥有多个IP地址（比如有多个以太口网卡）。第三项设置说明要注意对本机未经许可的电子欺骗。
7、使"/etc/services"文件免疫
使"/etc/services"文件免疫，防止未经许可的删除或添加服务：
# chattr +i /etc/services
8.阻止你的系统响应任何从外部/内部来的ping请求。
既然没有人能ping通你的机器并收到响应，你可以大大增强你的站点的安全性。你可以加下面的一行命令到/etc/rc.d/rc.local，以使每次启动后自动运行。
echo 1 > /proc/sys/net/ipv4/icmp_echo_ignore_all
9、对你的系统上所有的用户设置资源限制可以防止DoS类型攻击（denial of service attacks）
如最大进程数，内存数量等。例如，对所有用户的限制象下面这样：
vi /etc/security/limits.conf
下面的代码示例中，所有用户每个会话都限制在 10 MB，并允许同时有四个登录。第三行禁用了每个人的内核转储。第四行除去了用户 bin 的所有限制。ftp 允许有 10 个并发会话（对匿名 ftp 帐号尤其实用）；managers 组的成员的进程数目限制为 40 个。developers 有 64 MB 的 memlock 限制，wwwusers 的成员不能创建大于 50 MB 的文件。
清单 3. 设置配额和限制
* hard rss 10000
* hard maxlogins 4
* hard core 0
bin -
ftp hard maxlogins 10
@managers hard nproc 40
@developers hard memlock 64000
@wwwusers hard fsize 50000
要激活这些限制，您需要在 /etc/pam.d/login 底部添加下面一行： session required /lib/security/pam_limits.so
10、注释掉不需要的用户和用户组。
vipw
root:x:0:0:root:/root:/bin/bash
bin:x:1:1:bin:/bin:/sbin/nologin
daemon:x:2:2:daemon:/sbin:/sbin/nologin
adm:x:3:4:adm:/var/adm:/sbin/nologin
lp:x:4:7:lp:/var/spool/lpd:/sbin/nologin
sync:x:5:0:sync:/sbin:/bin/sync
shutdown:x:6:0:shutdown:/sbin:/sbin/shutdown
halt:x:7:0:halt:/sbin:/sbin/halt
mail:x:8:12:mail:/var/spool/mail:/sbin/nologin
news:x:9:13:news:/etc/news:
uucp:x:10:14:uucp:/var/spool/uucp:/sbin/nologin
operator:x:11:0:operator:/root:/sbin/nologin
games:x:12:100:games:/usr/games:/sbin/nologin
gopher:x:13:30:gopher:/var/gopher:/sbin/nologin
ftp:x:14:50:FTP User:/var/ftp:/sbin/nologin
nobody:x:99:99:Nobody:/:/sbin/nologin
dbus:x:81:81:System message bus:/:/sbin/nologin
vcsa:x:69:69:virtual console memory owner:/dev:/sbin/nologin
rpm:x:37:37::/var/lib/rpm:/sbin/nologin
haldaemon:x:68:68:HAL daemon:/:/sbin/nologin
netdump:x:34:34:Network Crash Dump user:/var/crash:/bin/bash
nscd:x:28:28:NSCD Daemon:/:/sbin/nologin
sshd:x:74:74:Privilerpc:x:32:32:Portmapper RPC user:/:/sbin/nologin
rpcuser:x:29:29:RPC Service User:/var/lib/nfs:/sbin/nologin
nfsnobody:x:65534:65534:Anonymous NFS User:/var/lib/nfs:/sbin/nologin
mailnull:x:47:47::/var/spool/mqueue:/sbin/nologin
smmsp:x:51:51::/var/spool/mqueue:/sbin/nologin
pcap:x:77:77::/var/arpwatch:/sbin/nologin
xfs:x:43:43:X Font Server:/etc/X11/fs:/sbin/nologin
ntp:x:38:38::/etc/ntp:/sbin/nologin
gdm:x:42:42::/var/gdm:/sbin/nologin
pegasus:x:66:65:tog-pegasus OpenPegasus WBEM/CIM services:/var/lib/Pegasus:/sbin/nologin
htt:x:100:101:IIIMF Htt:/usr/lib/im:/sbin/nologin
wangjing:x:500:500::/home/wangjing:/bin/bash
mysql:x:101:102:MySQL server:/var/lib/mysql:/bin/bash
apache:x:48:48:Apache:/var/www:/sbin/nologin
ge-separated SSH:/var/empty/sshd:/sbin/nologin
对于不需要的用户全部加 # 注释掉。注意，我不建议直接删除，当你某种原因需要某个用户时，自己重新会很麻烦。
vi /etc/group
root:x:0:root
bin:x:1:root,bin,daemon
daemon:x:2:root,bin,daemon
sys:x:3:root,bin,adm
adm:x:4:root,adm,daemon
tty:x:5:
disk:x:6:root
lp:x:7:daemon,lp
mem:x:8:
kmem:x:9:
wheel:x:10:root
mail:x:12:mail
news:x:13:news
uucp:x:14:uucp
man:x:15:
games:x:20:
gopher:x:30:
dip:x:40:
ftp:x:50:
lock:x:54:
nobody:x:99:
users:x:100:
dbus:x:81:
floppy:x:19:
vcsa:x:69:
rpm:x:37:
haldaemon:x:68:
utmp:x:22:
netdump:x:34:
nscd:x:28:
slocate:x:21:
sshd:x:74:
rpc:x:32:
rpcuser:x:29:
nfsnobody:x:65534:
mailnull:x:47:
smmsp:x:51:
pcap:x:77:
xfs:x:43:
ntp:x:38:
gdm:x:42:
pegasus:x:65:
htt:x:101:
wangjing:x:500:
mysql:x:102:
apache:x:48:
对于不需要的用户组全部加 # 注释掉。注意，我不建议直接删除，当你某种原因需要某个用户组时，自己重新会很麻烦。
11、用chattr命令给下面的文件加上不可更改属性。
[root@deep]# chattr +i /etc/passwd
[root@deep]# chattr +i /etc/shadow
[root@deep]# chattr +i /etc/group
[root@deep]# chattr +i /etc/gshadow
注意执行这个操作后，以root身份都不能向系统增加用户或者修改密码了。如果我们要增加用户或者修改密码的。应该先用chattr -i /etc/passwd等命令解除不可写设置，再进行操作。
12、改变sshd缺省端口
SSHD的默认端口就是 22 ，地球人都知道，通常黑客在没有准确目标的情况下要寻找 Linux机器的最好方法就是扫描所有开放了 22 端口的机器，然后放在一个列表里，一个个去探求它的漏洞。
比如 nmap4 的新功能 nmap -v -iR 10000 -P0 -p 22 可随机在10000个IP里去寻找开放了 22 端口的机器。当然也可以有目标的把日本或者其他国家的ip段添上再扫描。
通常是按照服务对应的常规端口去扫描，除非用全端口1-65535，但除非是针对性的对一台机器扫描，否则这样效率不高。www.britepic.org
把默认端口改变成60022的步骤如下：
vi /etc/ssh/sshd_config
找到#Port 22，标识默认使用22端口，如果需要更改为8888则去掉前面的 # 注释符号，修改为：Port 60022
然后重启服务进程
# /etc/init.d/sshd restart
sshd_config其他安全选项
把 #PermitRootLogin yes 改为 PermitRootLogin no 可防止 root 远程登陆
把 #Protocol 1,2 改 Protocol 2 ，不用 SSH protocol 1 协议，只用 2
当然还有一些选项，视需要而定，比如：Banner的伪造、登陆失败后的的锁定时间、是否允许空口令帐号登陆、服务器密钥的位数等、允许登陆的用户和IP等。
13、 内核参数调整
sysctl -w net.ipv4.conf.default.accept_source_route=0
sysctl -w net.ipv4.icmp_echo_ignore_broadcasts=1
#sysctl -w net.ipv4.icmp_echo_ignore_all=1
sysctl -w net.ipv4.icmp_ignore_bogus_error_responses=1
sysctl -w net.ipv4.ip_conntrack_max=65535
sysctl -w net.ipv4.tcp_syncookies=1
sysctl -w net.ipv4.tcp_syn_retries=1
sysctl -w net.ipv4.tcp_fin_timeout=5
sysctl -w net.ipv4.tcp_synack_retries=1
sysctl -w net.ipv4.tcp_syncookies=1
sysctl -w net.ipv4.route.gc_timeout=100
sysctl -w net.ipv4.tcp_keepalive_time=500
sysctl -w net.ipv4.tcp_max_syn_backlog=10000
14、经常检查系统日志。系统日志主要位于/var/log/目录下。防患于未然。
通过以上设置你的系统一般来说就比较安全了。当然安全与不安全是道与魔的斗争