在Linux和windows平台下MySQL服务器的启动方式有很大不同，这里将分开介绍：
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Linux平台：
Linux平台下，每一个进程都需由一个用户来运行，MySQL最好不要以root用户来运行。我们可创建一个mysql用户和mysql组，MySQL服务器程序目录和数据目录由这个用户和组所拥有，其它用户没有任何权限。以mysql用户来运行MySQL服务器。
% mysqld --user=mysql #即使以root用户执行该命令，MySQL数据库还是会与mysql用户ID关联。
为了使服务器在系统启动时自动以mysql用户运行，需配置my.cnf配置文件 ，把user=mysql包含在[mysqld]段中。
关闭服务器可用% mysql.server stop或% mysqladmin -u root -p shutdown
windows平台：
手动方式：直接运行c:\mysqld命令。
作为服务方式：运行c:\mysqld-nt --install命令，把mysqld-nt安装为windows的服务，此后，每当windows启动时，它就会自动运行。mysqld-nt是一个支持命名管道的MySQL服务器。运行c:\mysqld-nt --remove可把服务删除。手动启动关闭服务的方法是运行c:\net start mysql和c:\net stop mysql命令。
当由于误删mysql套接字时(/tmp/mysql.sock)，我们就不能通过套接字连接服务器。这时我们可通过tcp/ip来连接服务器，要建立一个tcp/ip连接，需用127.0.0.1代替locahost作为-h参数的值来连接服务器。如：
% mysqladmin -h 127.0.0.1 -u root -p shutdown #关闭服务器再重启会重建套接字
当我们因为忘记root用户密码而不能连接服务器时，重设置密码的步骤如：
用 % kill -TERM PID关闭服务器，用-TERM信息可使服务器在关闭前把内存中的数据写入磁盘。如果服务器没有响应，我们可用% kill -9 PID来强制删除进程，但不建议这样做。这时内存中的数据不会写入磁盘，造成数据不完整。如果你是用mysql_safe脚本启动MySQL服务器的，这个脚本会监控服务器的运行情况并在它被终止时重启服务器，所以如需关闭服务器，要先终止该进程，然后再真正终止mysqld进程。
接着用--skip_grant-tables启动服务器。这时MySQL服务器将不使用权限表对连接操作进行验证。你就可在不提供root密码的情况下连接上服务器，并获得root的权限。这样你就可用上面介绍的修改密码的方法重设root用户的密码。注意：连接上服务器后，要马上执行flush privileges命令，使权限表读入内存并生效，以阻止其他的连接。该语句还重新激活grant语句，在MySQL服务器不使用权限表时，grant语句被禁用。
修改完root用户密码后，我们就可关闭服务器并重启使所有配置正常运作。